Раздел [boot loader]:

timeout - количество секунд до загрузки системы по умолчанию. Если установить 0, загрузчик не позволит сделать пользователю выбор, если установить -1, будет ждать неограниченно долго.
default - путь к операционной системе (ОС), загружаемой по умолчанию, указывается с использованием имен ARC (Advanced RISC Computer).

ARC - это соглашение о формировании имен, которое используется для определения уникальной комбинации контроллера, диска и раздела, описывающей загрузочный раздел ОС. Имя ARC состоит из следующих элементов:

1) scsi(*) или multi(*) - элемент scsi(*) используется в случае контроллера SCSI с отключенным BIOS. Элемент multi(*) используется для дисков всех остальных типов, включая IDE, EIDE, ESDI и SCSI с включенным BIOS. (*) - номер адаптера, с которого осуществляется загрузка. Адаптеры нумеруются с нуля, начиная с контроллера, расположенного ближе к слоту 0 на мат. плате.
2) disk(*) - если (1) = scsi(*), то равен логическому номеру устройства (LUN), установленному для диска. Если (1) = multi(*), то всегда равен нулю.
3) rdisk(*) - если (1) = multi(*), то равен номеру диска в цепочке, счет дисков начинается с 0. Если (1) = scsi(*), то всегда равен нулю.
4) partition(*) - определяет дисковый раздел, содержащий файлы ОС. В отличие от всех остальных элементов имен ARC нумерация разделов начинается с 1, т.е. первый раздел обозначается partition(1), второй - partition(2) и т.д.
5) \path - определяет каталог (или подкаталог) раздела, в котором находятся файлы ОС. По умолчанию в Windows NT/2000 используется путь \WINNT.

Раздел [operating systems]:
/BASEVIDEO - загрузка с использованием стандартного драйвера VGA. Может помочь при некорректной работе основного драйвера.
/BAUDRATE - устанавливает скорость (бод) COM-порта для отладки. По умолчанию будет 9600 для модема и 19200 для нуль-модема. Устанавливает также принудительно параметр /DEBUG.
/BOOTLOG - запись протокола загрузки в файл %SystemRoot%\ntbtlog.txt. Можно выяснить, какие драйверы остались незагруженными.
/CRASHDEBUG - отладчик загружается при запуске системы, но остается в неактивном состоянии до возникновения ошибки ядра.
/DEBUG - система переводится в отладочный режим. Отладчик активизируется удаленным хостом отладчика.
/DEBUGPORT= COMx - указывает COM-порт, который будет использоваться при отладке, где x - номер коммуникационного порта. Также принудительно устанавливает параметр /DEBUG.
/FASTDETECT - система не будет распознавать устройства PnP при начальной загрузке (в отличие от NT, W2k способна определить их позже)
/MAXMEM - определяет максимальный объем памяти, доступный Windows. Может помочь при диагностике неисправного чипа памяти.
/NODEBUG - запрещает вывод отладочной информации на экран.
/NOGUIBOOT - отключает графическую заставку при начальной загрузке и инициализацию драйвера VGA, выполняющего её вывод. Hо т.к. этот драйвер ответственен ещё за показ BSOD и отображение работы scandisk при загрузке, их мы тоже не увидим :(
/NOSERIALMICE=[COMx,y,z,...] - блокирует определение мыши на указанных COM-портах. Без параметров - блокирует для всех COM-портов.
/SAFEBOOT - используется для загрузки Windows в Safe Mode. При нажатии клавиши F8 в меню начальной загрузки происходит конфигурация его дополнительных параметров, которые можно указать явно после двоеточия: MINIMAL (соответствует опции Safe Mode), NETWORK (Safe Mode with Network) и DSREPAIR (режим Directory Service Repair - восстановление Active Directory с носителя резервной копии - только для версии Server). Кроме этого, есть ещё одна опция: ALTERNATESHELL - позволяет задать альтернативную графическую оболочку, которая должна быть указана в ключе реестра HKLM\System\CurrentControlSet\SafeBoot\AlternateShell. По умолчанию используется Explorer.
/SOS - при загрузке на экране отображаются имена всех загружаемых драйверов. Также может быть рекомендован для отмены графической заставки при начальной загрузке Windows 2000.

Более подробно почитать о ключах в файле boot.ini можно в книге "Windows 2000: Server и Professional. Русские версии" под общей редакцией Алексея Чекмарева и Дмитрия Вишнякова изд. BHV (c) 2000.

См. также статью на сайте Microsoft "Редактирование файла Boot.ini в Windows XP".