Компилирование модуля исходного кода main.c в объектный файл main.o: 

avr-gcc -g -Os -mmcu=atmega8 -c main.c

Линковка файла main.o в двоичный файл main.elf: 

avr-gcc -g -mmcu=atmega8 -o main.elf main.o

Получение файла прошивки в формате Intel HEX [1]: 

avr-objcopy -j .text -j .data -O ihex main.elf main.hex

[Ссылки]

1. Intel HEX: описание формата файла.